Немного ошибся и не модернизировал везде скрипты при обновлении, в результате при выходе новой ветки извещений о новой версии не получил. А все почему? Сравнение нужно делать правильно.

Не правильно
$Installed < $Latest

Правильно
$Installed != $Latest

Например мы сравниванием версии 6.45.6 (Installed) и 6.46 (Latest). Получается, что Mikrotik берет значение как число и выходит, что 646 (Latest) никак не может быть больше 6.45.6 (Installed) . В итоге неправильное сравнение больше-меньше конечно будет работать, но не во всех случаях. Для обеспечения универсальности лучше использовать сравнение. Иными словами, если у нас есть различия в версии, то явно нужно обновляться.